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Sebastián Guillén Ludeña es profesor permanente laboral del area de Ingeniería Hidráulica de la Universidad Politécnica de Cartagena (UPCT) . En la actualidad trabaja en el proyecto EFISED sobre la eficacia del vaciado de embalses para la evacuación de sedimentos (Flushing), financiado por el programa Saavedra Fajardo de la Fundación Séneca de la Región de Murcia.
Sebastián Guillén Ludeña es desde 2006, Ingeniero de Caminos, Canales y Puertos con la especialidad de Hidráulica y Energía por la Univ. Politécnica de Madrid (UPM), y desde 2015 Docteur ès Sciencies por la École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL) (Suiza) y por el Instituto Superior Técnico de Lisboa (IST) (Portugal).
Sebastián Guillén Ludeña ha trabajado como ingeniero en el sector privado, participando en el diseño y supervisión de la construcción de obras hidráulicas. En 2010 obtuvo el Diploma de Estudios Avanzados (DEA) del programa de doctorado de Hidráulica y Energía de la UPM. En 2011 obtuvo una beca del programa IST-EPFL Joint Doctoral Initiative para la realización de la tesis doctoral, que presentó en 2015 con el título: "Hydro-morphodynamics of open-channel confluences with low discharge ratio and dominant tributary sediment supply". Esta tesis está basada en experimentos de laboratorio en los que se estudiaron la hidrodinámica y morfodinámica de confluencias fluviales. En 2016, Sebastián Guillén Ludeña fue contratado como investigador posdoctoral por el Laboratoire de Mécanique des Fluides et d'Acoustique (LMFA) del INSA de Lyon (Francia), para trabajar en el proyecto FLOWRES sobre la resistencia hidráulica en inundaciones extremas. En 2017, Sebastián Guillén Ludeña se incorporó como investigador posdoctoral al Laboratoire de Constructions Hydrauliques (LCH) de la EPFL (Suiza) para trabajar en el proyecto FLEXSTOR sobre la sedimentación en embalses.
Sebastián Guillén Ludeña es coautor de 9 publicaciones científicas en revistas indexadas y de numerosas comunicaciones en congresos internacionales sobre la ingeniería hidráulica y medioambiental. Además, Sebastián Guillén Ludeña ha participado en al revisión de numerosos artículos de revistas indexadas.
Los intereses en materia de investigación de Sebastián Guillén Ludeña incluyen: Hidrodinámica, dinámica de sedimentos, sedimentación en embalses, geomorfología fluvial.